Termék bemutatása
|
Termék neve |
Macska. Nem. |
Spec. |
|
2× Fast SYBR Green qPCR Master Mix (alacsony ROX) |
G3324-01 |
1 ml |
|
G3324-05 |
5×1 ml |
|
|
G3324-15 |
15×1 ml |
Termékleírás/Bevezetés
A 2× Fast SYBR Green qPCR Master Mix (Low ROX) egy speciális 2×-es premix a qPCR reakcióhoz SYBR Green I kiméra fluoreszcencia módszerrel, amely a primerek és a DNS templátok kivételével az összes qPCR komponenst tartalmazza, ami csökkentheti a műveleti lépéseket, lerövidítheti az időt. minták hozzáadásával, és csökkenti a szennyeződés esélyét. A központi komponens a géntechnológiával módosított hot-start Taq DNS polimeráz, amely hatékonyan zárja le a DNS polimeráz aktivitást, és alacsony hőmérsékleten megakadályozza a nem specifikus amplifikációt azáltal, hogy hatékonyan kombinálja a monoklonális antitestet és a Taq DNS polimerázt, számos előnnyel, mint például a nagy specificitás és nagy érzékenység, és qPCR-re optimalizált reakciópufferrel van összekapcsolva. Nagyon alkalmas nagy specificitású és nagy érzékenységű qPCR reakcióhoz. Ez a termék egy 2× előkevert reagens, amely a SYBR Green I optimális koncentrációját tartalmazza a qPCR reakcióhoz, amely széles kvantitatív régióban jó standard görbét kaphat, a célgének pontos mennyiségi meghatározását, jó reprodukálhatóságot, nagy megbízhatóságot és a leggyorsabb qPCR reakciót 30 perc alatt teljesíthető.
Tárolási és szállítási feltételek
Nedves jéggel szállítjuk. Tárolás -20 fokon világítás nélkül, 12 hónapig érvényes. Kerülje a fagyasztás-olvadási ciklusokat. Felolvasztás után 4 fokon stabilan tárolható egy hónapig fény nélkül.
Termék tartalma
|
Összetevő |
G3324-01 |
G3324-05 |
G3324-15 |
|
2×Fast SYBR Green qPCR Master Mix (alacsony ROX) |
1 ml |
5×1 ml |
15×1 ml |
|
Kézikönyv |
Egy példány |
||
Assay Protokoll / Eljárások
Mielőtt elkezdené
1. Valós idejű PCR amplifikációs műszer;
2. Speciális reakciócső vagy reakciólap kísérlethez;
3. PCR primerek (referencia primer tervezési elvek);
4. Mikropipetta és autoklávozó hegyek;
Eljárások
1. Javasolt PCR reakciórendszer
|
Összetevő |
20 μL rxn |
50 μL rxn |
Végső koncentráció |
|
2×Fast SYBR Green qPCR Master Mix (alacsony ROX) |
10 μL |
25 μL |
1× |
|
Előre Primer (10 μM)a |
0.4 μL |
1 μL |
0.2 μM |
|
Fordított primer (10 μM)a |
0.4 μL |
1 μL |
0.2 μM |
|
Sablonb |
Változó |
Változó |
igény szerint |
|
Nukleázmentes víz |
Adjunk hozzá 20 μL-hez |
Adjuk hozzá 50 μl-hez |
a. Általában jó amplifikációs hatás érhető el {{0}},2 μM végső koncentrációval. Ha a reakció gyenge, a primer koncentrációja a 0.2-1,0 μM tartományban állítható.
b. A hozzáadott templát mennyisége a célgén másolatainak számától függően változik, és a templát hozzáadásának megfelelő mennyiségét gradiens hígítással vizsgálják. A 20 μl-es reakciórendszerben a templát DNS legjobb hozzáadott mennyisége 100 ng-nál kisebb volt. Ha az RT-PCR reakció cDNS-ét (RT reakcióoldatot) használtuk templátként, a hozzáadott mennyiség nem haladhatja meg a végső qPCR térfogat 10%-át.
2. PCR reakció menete (a műszerek szerint állítható):
3.
|
Színpad |
Lépés |
Ciklusok száma |
Hőmérséklet |
Idő |
|
1. szakasz |
Predegeneráció |
1 |
95 fok |
30 seca |
|
2. szakasz |
Degeneráció |
40 |
95 fok |
3-10 mp |
|
lágyítás-hosszabbítás |
60 fok |
10-30 mp |
||
|
3. szakasz |
olvadási görbe |
1 |
A műszer alapértelmezett beállításai |
|
A megfelelő márka fluoreszcens kvantitatív PCR műszerének gyors eljárása javasolt előnyben részesíteni, amely kompatibilis a standard amplifikációs eljárással. A gyorseljárás a legtöbb génre alkalmas, a standard eljárás pedig néhány bonyolult másodlagos szerkezetű gén esetében kipróbálható.
a: A genom templát 2-3 perccel meghosszabbíthatja a degeneráció előtti időt;
b: Ciklus szakasz: a standard eljárás denaturálási ideje 10 mp. Ha az amplifikált fragmentum 200 bp-nál kisebb, a gyors eljárás legrövidebb lehetősége 3 másodperc.
c: Ciklus szakasz: a standard eljárás lágyítási/nyújtási ideje van kiválasztva 30 másodpercre; Ha az amplifikált fragmens 200 bp-nál kisebb, a legrövidebb eljárás 10 másodperces lehet. 200 bp felett az ajánlott választás 30 mp; A fluoreszcencia jelek gyűjtéséhez állítsa be a kísérleti eljárást a műszer használati útmutatója szerint.
Jegyzet
1. Használat előtt óvatosan keverje fel fejjel lefelé. Ne kavargassa és ne rázza meg a buborékok elkerülése érdekében. Használat előtt alaposan keverje össze a reagenseket.
2. A reakcióoldat elkészítésekor a reagenseket jégre kell helyezni.
3. A termék SYBR Green fluoreszcens festéket tartalmaz, ezért a PCR reakcióoldat elkészítésekor kerülni kell az erős fényt.
4. Kérjük, használjon új eldobható fejet a reakcióoldat elkészítéséhez és csomagolásához, hogy elkerülje a minták közötti szennyeződést.
5. Kerülje a Master Mix ismételt fagyasztását-olvasztását, és próbálja meg a felengedés után egy hónapon belül felhasználni.
Kompatibilis hangszerek
|
PCR gép márkája |
G3323 (Nincs ROX) |
G3324 (alacsony ROX) |
G3325 (Magas ROX) |
|
ABI Thermo élettartam |
PikoRealTM Kerékpáros |
7500/7500 gyors, ViiA 7™ QuantStudio™ sorozat |
5700/7000/7300/7700/7900/ 7900HT/7900 HT Fast, StepOne™, StepOne Plus™ |
|
Stratagene |
Mx3000P®/3005P™/4000™ |
||
|
Bio-Rad |
Minden sorozat |
||
|
Eppendorf |
Realplex 2s, Mastercycler®ep realplex |
||
|
IIIumina |
Eco QPCR |
||
|
Cefeida |
SmartCycler® |
||
|
Qiagen Corbett |
Rotor-Gene® sorozat |
||
|
Roche |
LightCycler™ sorozat |
||
|
Takara |
Thermal Cycler Dice sorozat |
||
|
Analytikjena |
qTOWER sorozat |
||
|
qTOWER |
LineGene sorozat |
Primer tervezési alapelvek
1. Az amplifikációs szorzat hossza javasolt, hogy 80-300 bp között legyen;
2. Alapozó hossza: 18-25 bp;
3. A primerekben a bázis G+C tartalma 40%-60% között legyen;
4. A forward primerek és a fordított primerek közötti Tm-érték különbség kisebb, mint 2 fok, és a 58-62 fok közötti Tm-érték a legjobb;
5. Az alapeloszlás véletlenszerűsége;
6. A primerek jobb, ha nem tartalmaznak önkomplementer szekvenciákat, különben másodlagos hajtűszerkezetet alkotnak;
7. Két primer között legfeljebb 4 komplementer vagy homológ bázis lehet, különben primer dimer képződik, különösen a 3' végén komplementer átfedés;
8. A primer 3' terminális bázisa G vagy C lehet;
9. Az NCBI összehasonlítási eredményeiben nem találtunk más nem specifikus terméket.
Hibaelhárítás
|
Probléma leírása |
Lehetséges okok |
Megoldások |
|
A reakció végén nem jelent meg amplifikációs görbe, vagy túl későn jelent meg a CT érték |
A sablonkoncentráció túl alacsony |
Ismételje meg a kísérletet, hogy csökkentse a templát hígítási többszörösét, és kezdje a legmagasabb koncentrációval, ha a minta koncentrációja ismeretlen |
|
Sablon degradáció |
A sablont újra elkészítettük, és a kísérletet megismételtük |
|
|
A rendszerben PCR-gátlók vannak |
Általában a templátot bevisszük, a templát hígítási arányát növeljük, vagy a nagy tisztaságú templátot újrakészítjük és megismételjük. |
|
|
Az alapozók lebomolhatnak |
A hosszabb ideig nem használt primerek integritását először PAGE elektroforézissel kell ellenőrizni, hogy kizárják a lebomlás lehetőségét. |
|
|
Alacsony erősítési hatásfok |
Növelje a primer koncentrációját, próbáljon ki egy háromlépéses amplifikációs eljárást, vagy tervezze újra a primert |
|
|
Az erősítő termék túl hosszú |
Az amplifikációs termék hosszát 80-300 bp tartományban szabályoztuk |
|
|
Az üres vezérlő mutatja a jelet |
A reakciórendszer szennyezése |
Először is ki kell cserélni az üres kontrollvizet. Ha ugyanaz a helyzet továbbra is fennáll, a primereket, az aspirátorokat és a PCR csöveket ki kell cserélni, vagy új Master Mixet kell indítani. A reakciórendszert szupertiszta asztalon készítik el az aeroszolszennyezés csökkentése érdekében |
|
Nem specifikus amplifikáció, például primer dimerek jelennek meg |
Általában normális, hogy az amplifikációs termékek 35 ciklus után megjelennek a vak kontrollban, amelyet az olvadásgörbével kell elemezni. Tervezze újra a primert, állítsa be a primer koncentrációját vagy optimalizálja a PCR reakcióeljárást |
|
|
Az olvadási görbének több csúcsa van |
Az alapozó kialakítása gyenge |
Az új alapozót az alapozó tervezési elveinek megfelelően alakították át |
|
Az alapozó koncentrációja túl magas |
Csökkentse megfelelően az alapozó koncentrációját |
|
|
A cDNS-templátban genomiális szennyeződés található |
Az extrahált RNS-oldatot DNS-enzimekkel, például dsDNázzal emésztjük a genomiális szennyeződés eltávolítása vagy a transzintron primerek tervezése céljából. |
|
|
A kísérletek rossz reprodukálhatósága |
A minta hozzáadásának hibája nagy |
Pontos pipetta használata, kiváló minőségű szívófejjel, pontos pipetta; Magas hígítású sablon, nagy térfogatú sablon hozzáadása a mintavételi hiba csökkentése érdekében; A qPCR reakciótérfogata megnőtt |
|
A sablonkoncentráció túl alacsony |
Ismételje meg a kísérletet a sablon hígítási idejének csökkentése érdekében |
|
|
Hőmérséklet-eltérés a qPCR műszer különböző helyein |
Rendszeresen kalibrálja a qPCR műszert |
|
|
Az erősítési görbe nem sima |
A fluoreszcencia jel túl gyenge, rendszerkorrekció után keletkezik |
Győződjön meg arról, hogy a Master Mixben előkevert színezékek nem bomlanak le; Cserélje ki a fluoreszcens jelet a jobb qPCR kellékek összegyűjtéséhez |
|
Az erősítési görbe megtörik vagy elcsúszik |
A templátkoncentráció magasabb volt, és az alapvonal végpontértéke nagyobb volt, mint a CT-érték |
Az alapvonal végpontját (Ct-érték -3) csökkentették, és az adatokat újra elemezték |
|
Az egyes Wells amplifikációs görbéi hirtelen meredeken estek |
Buborékok vannak a reakciócsőben |
Győződjön meg arról, hogy a MIX teljesen feloldódott, és ne örvényljön és ne rezegjen egyenletesen; A minta hozzáadása után a buborékokat könnyű elasztikus centrifugálással eltávolítjuk. Az elődenaturálási időt 10 percre meghosszabbítottuk a buborékok eltávolítására |
Csak kutatási célra!
Népszerű tags: 2 × gyors sybr zöld qpcr master mix (low rox), Kína 2 × gyors sybr green qpcr master mix (low rox) gyártók, beszállítók, gyár
